Ein Hauptanwendungsbereich für Ergometer gibt es in der Medizin. In der Leistungsphysiologie und in der Sportmedizin werden Ergometer zur Analyse von Ausdauerfunktionen und zur Überprüfung einiger Gesundheitsparameter benutzt z. B. bei einem Belastungs-EKG. Auch im Rehabilitationsbereich werden Ergometer verstärkt eingesetzt. Nach deutschem Recht müssen Ergometer für die medizinische Anwendung alle zwei Jahre nachkalibriert werden.
Aber auch im Freizeit- und Fitnessbereich erfahren Ergometer eine zunehmende Fangemeinde. Gerade das wetterunabhängige Training, die Computersteuerung mit diversen Trainingsprogrammen und die Möglichkeit fast aller Ergometer, sie mit dem PC zu verbinden, sorgen für vielfältige Einsatzmöglichkeiten. Durch den Anschluss an den PC wird es möglich, die Leistungsdaten zu erfassen und zu vergleichen.